１９８４年底，广州市体委决定大胆尝试，采用企业赞助队伍的合作方式组建广州足球代表队。为此，广州足球办公室分别向各区、单位、企业发函，征求合作组队的意见，当时在受邀请的企业单位中，白云山制药厂的反应最为积极。在时任国家体委副主任、中国足协主席黄中和国家体委副主任徐寅生的鼓励下，广州市体委和白云山制药厂经过友好协商，于１９８４年１０月签署合作协议，联合组建广州足球队，队伍正式改名为广州白云山制药厂体协足球队（简称白云足球队）。广州白云足球队的正式挂牌，开创了中国企业与体委合办运动队的先河，为体育改革摸索出一条新路子，由此在全国掀起了企业赞助运动队的高潮，使中国体育事业进入到了一个新的时代。

白云足球队的建立，令广州足球迅速崛起。在同年１０月举行的首届中国足协杯赛上，广州白云足球队跻身８强，重返甲级行列，中场球员赵达裕还被评为首届足协杯“最佳运动员”。之后的４年，白云足球队始终名列全国甲级联赛第７名。１９９０年广州白云足球队以甲级联赛Ｂ组第２名身份进入甲Ａ行列；１９９１年获甲级联赛Ａ组第４名；１９９２年一举夺得了广州足球史上的第一个全国足球甲Ａ联赛亚军，为“白云时代”的广州足球写下最辉煌的一页。当年的广州白云队，前锋线拥有著名国脚吴群立和胡志军以及罗文胜、黄伟雄等各具特点的骁将；中场拥有著名国脚麦超、彭伟国以及李勇、蔡庆辉、吕建军等名将；后防由沈嵘、黄启能、彭锦波、彭昌颖等球员把守；孔国贤和黄洪涛则堪称广州足球史上最优秀的两位门将。

在市体委与白云山制药厂合办广州足球队期间，广州足球还创出国内足坛的多项“吃螃蟹”之举：聘请原国家队教练戚务生任主教练，引进李公一、路建人、李勇等外省籍球员，迈出了国内人才交流的第一步；率先对职业化的管理制度作出尝试，即实行球员自我管理的走训制，打破运动员队伍长期集中住宿的一贯制，引起了当时国内体坛的强烈反响。

１９９３年，广州足球队以招标形式，由广东太阳神集团有限公司接手，广州足球的“白云时代”画上句号。